برنامه اصلاح بادمجان با جمع آوری ژرم پلاسم متنوع از مناطق مختلف ایران و جهان آغاز شده است. اهداف اصلاحی شامل ایجاد ارقام هیبرید با عملکرد و کیفیت بالای میوه، مقاومت به تنش های مهم زیستی(ساق سیاه، سفیدک سطحی و …) و غیر زیستی، شکل‌های متفاوت میوه (قلمی و دلمه ای) و رنگ های متفاوت آن می باشد.